Next-Generation Sequencing:
Die Entwicklung von Hochdurchsatz-Sequenzierungsmethoden (NGS: Next-Generation Sequencing) hat den Zugang zu Genom- und Transkriptom-Sequenzen auch aus Nicht-Modellorganismen erheblich erliechtert. Diese Methoden werden auf einzelne Zellen (single cell analyses), Gewebe und Organismen und sogar auf Umweltproben mit ihren z.T. sehr komplexen Organismengemeinschaften angewendet.
NGS wird in verschiedenen Forschungsbereichen eingesetzt, z.B.:
- Genom-Sequenzierungen
- Transkriptom-Sequenzierungen, differentielle Expressionsanalyse
- Genotypische Variationen (SNP/InDel)
- ChIP-Sequenzierungen
- Amplikon-Sequenzierungen (Barcoding)
Das Keylab unterstützt Sie in NGS-Bioinformatik-Anwendungen und in der Analyse von NGS-Sequenzdaten.
Ausgewählte Literatur:
- Vergleich von NGS-Systemen: Liu L, Li Y, Li S et al. (2012) Comparison of next-generation sequencing systems. J. Biomed. Biotechnol. 2012: 251364. doi: 10.1155/2012/251364
- NGS Community und NGS-Software: Li J, Schmieder R, Ward RM et al. (2012) SEQanswers: an open access community for collaboratively decoding genomes. Bioinformatics 28(9): 1272–1273. doi: 10.1093/bioinformatics/bts128
- NGS Wikipedia Artikel: http://en.wikipedia.org/wiki/Next_generation_sequencing