Qiime2: Quantitative Insights Into Microbial Ecology.
Link: qiime2.org
Qiime2 ist eine Microbiom-Analyseplattform um z.B. Amplicon-Sequenzdaten aus Barcodingregionen (16S, 18S, ITS, usw.) auszuwerten.
Diese Analysetool liefert u.a. folgende Ergebnisse:
- Taxonomische Zuordnungen (Bar-Plots, Matrices)
- Statistische Auswertungen (Distanzen, PCOA, Rarefaction, Faktorenanalyse)
- Publikationsfähige Graphiken